More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1073 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1073  Maf-like protein  100 
 
 
180 aa  358  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.41751  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0614  Maf-like protein  54.1 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0535  Maf-like protein  54.1 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1428  Maf-like protein  53.01 
 
 
183 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0684  Maf-like protein  49.17 
 
 
181 aa  164  9e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1031  Maf-like protein  51.38 
 
 
182 aa  162  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000336605  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0049  Maf-like protein  48.62 
 
 
180 aa  154  8e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0984  Maf-like protein  46.96 
 
 
182 aa  145  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1896  Maf-like protein  40.98 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1665  maf protein  35.03 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0919087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2272  Maf-like protein  28.96 
 
 
201 aa  87.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0638  Maf-like protein  28.49 
 
 
206 aa  85.1  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2658  Maf-like protein  31.4 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0546169  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0322  Maf-like protein  28.33 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0212  Maf-like protein  27.37 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.756505 
 
 
-
 
NC_004310  BR0248  Maf-like protein  27.78 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.50126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0186  maf protein  27.27 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  30.64 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1507  maf protein  29.31 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0470  maf protein  27.72 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4312  maf protein  28.49 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3331  maf protein  27.17 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  30.64 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  30.06 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  30.06 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2217  Maf-like protein  27.03 
 
 
210 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1125  maf protein  30.05 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.251445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  30.06 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2338  Maf-like protein  27.03 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4564  Maf-like protein  30.05 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00553561  normal  0.647968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4408  Maf-like protein  30.05 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000616092  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  30.06 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  28.9 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  30.06 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2113  maf protein  30.64 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0186  Maf-like protein  27.93 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  29.48 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03107  Maf-like protein  29.67 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0459  maf protein  29.67 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0394308  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2852  maf protein  26.82 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3279  Maf-like protein  29.12 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00231758  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2628  maf protein  26.82 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.641863 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0459  Maf-like protein  29.67 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00615525  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0266  Maf-like protein  27.22 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000000929962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  30.39 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3437  Maf-like protein  29.67 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00398739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03058  hypothetical protein  29.67 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00132702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0779  Maf-like protein  28.26 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0408  maf protein  26.55 
 
 
202 aa  72  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.490696  normal  0.258397 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  33.52 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3543  Maf-like protein  29.12 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454216  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0271  Maf-like protein  29.05 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  29.35 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0243  Maf-like protein  28.49 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  29.51 
 
 
207 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3730  Maf-like protein  29.12 
 
 
197 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000662199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3634  Maf-like protein  29.12 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.443477  hitchhiker  0.0041574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3562  Maf-like protein  29.12 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.036153  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5627  Maf-like protein  27.17 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3684  Maf-like protein  29.12 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.201425  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0512  Maf-like protein  28.74 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3563  Maf-like protein  29.12 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3674  maf protein  28.8 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  28.32 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0527  maf protein  26.01 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0831909  normal  0.0651324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2752  maf protein  26.82 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0255  Maf-like protein  29.48 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0124527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4414  Maf-like protein  30.17 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699911  normal  0.620193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3669  Maf-like protein  28.57 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68747  normal  0.628888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5018  Maf-like protein  28.33 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4095  maf protein  28.49 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0240  maf protein  26.74 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0757  maf protein  27.37 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00314936 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0177  maf protein  30.11 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0801823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2323  Maf-like protein  26.49 
 
 
210 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.768418 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0978  Maf-like protein  26.09 
 
 
210 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.246189  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  28.07 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2952  maf protein  24.16 
 
 
217 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  28.96 
 
 
207 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2196  Maf-like protein  28.96 
 
 
207 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2528  Maf-like protein  28.02 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0518  Maf-like protein  28.74 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3189  putative inhibitor of septum formation  25.68 
 
 
210 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4276  Maf-like protein  30.56 
 
 
207 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0849275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0577  maf protein  26.84 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0344402  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0277  Maf-like protein  27.93 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31345  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3344  maf protein  26.23 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4346  Maf-like protein  29.83 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12680  Maf-like protein  25.29 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2723  maf protein  27.68 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2138  maf protein  25.88 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3735  maf protein  27.68 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3731  Maf-like protein  28.57 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  0.0857351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4111  maf protein  27.59 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0900  Maf-like protein  28.73 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  28.49 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1688  Maf-like protein  27.03 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2300  Maf-like protein  27.03 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3645  maf protein  29.61 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2870  maf protein  26.59 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>