240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1050 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1050  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
440 aa  870    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0627  apolipoprotein N-acyltransferase  64.03 
 
 
421 aa  529  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1238  apolipoprotein N-acyltransferase  63.9 
 
 
441 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.470071  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1113  apolipoprotein N-acyltransferase  64.13 
 
 
441 aa  527  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.268777  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  39.76 
 
 
419 aa  290  4e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0478  apolipoprotein N-acyltransferase  40.6 
 
 
396 aa  281  1e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0069  apolipoprotein N-acyltransferase  39.53 
 
 
387 aa  281  1e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0725  apolipoprotein N-acyltransferase  36.83 
 
 
411 aa  224  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.360623  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1577  apolipoprotein N-acyltransferase  36.01 
 
 
412 aa  219  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  25.61 
 
 
479 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  26.27 
 
 
528 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  24.94 
 
 
502 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  22.49 
 
 
505 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1566  apolipoprotein N-acyltransferase  25.44 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.910854  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  25.29 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  22.9 
 
 
525 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  26.15 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  25.15 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  25.88 
 
 
562 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  25.88 
 
 
562 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  27.27 
 
 
505 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  25.78 
 
 
521 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2726  apolipoprotein N-acyltransferase  25.18 
 
 
567 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  25.49 
 
 
528 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  26.82 
 
 
520 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  24.29 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  24.49 
 
 
510 aa  74.7  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  24.84 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  22.04 
 
 
503 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  22.02 
 
 
503 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  26.75 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  21.85 
 
 
523 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  25.69 
 
 
497 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  23.93 
 
 
506 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  23.79 
 
 
543 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  27.64 
 
 
516 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  25.44 
 
 
507 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0600  apolipoprotein N-acyltransferase  26.51 
 
 
553 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  27.13 
 
 
516 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 
522 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  26.41 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  23.42 
 
 
512 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2087  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 
567 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  26.23 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2699  apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 
567 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000283733  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  27.9 
 
 
519 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  23.9 
 
 
509 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6026  apolipoprotein N-acyltransferase  24.91 
 
 
562 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115466  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0586  apolipoprotein N-acyltransferase  24.8 
 
 
571 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  23.42 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  24.67 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  24.69 
 
 
505 aa  70.5  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  23.42 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  23.42 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  23.42 
 
 
512 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  22.67 
 
 
553 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  23.48 
 
 
522 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  24.89 
 
 
507 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  23.42 
 
 
512 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0220  apolipoprotein N-acyltransferase  24.5 
 
 
568 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0883  apolipoprotein N-acyltransferase  24.5 
 
 
568 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  23.34 
 
 
510 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  24.42 
 
 
509 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2726  apolipoprotein N-acyltransferase  24.5 
 
 
568 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  22.69 
 
 
567 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2352  apolipoprotein N-acyltransferase  24.5 
 
 
568 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0703  apolipoprotein N-acyltransferase  24.5 
 
 
568 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0718  apolipoprotein N-acyltransferase  24.5 
 
 
568 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428564  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2432  apolipoprotein N-acyltransferase  24.5 
 
 
568 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959301  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  23.19 
 
 
532 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  23.12 
 
 
512 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  23.4 
 
 
576 aa  68.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  23.13 
 
 
532 aa  68.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  23.12 
 
 
508 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  23.26 
 
 
567 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  23.55 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  25.32 
 
 
510 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  24.26 
 
 
495 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  23.12 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  22.71 
 
 
507 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  24.76 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  24.45 
 
 
536 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  27.02 
 
 
519 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  24.28 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  25.71 
 
 
534 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  23.77 
 
 
511 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  25.81 
 
 
524 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.26 
 
 
495 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0524  apolipoprotein N-acyltransferase  24.15 
 
 
532 aa  67  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0553952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  25.61 
 
 
524 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  22.97 
 
 
541 aa  66.6  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0540  apolipoprotein N-acyltransferase  24.15 
 
 
532 aa  66.6  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  25.25 
 
 
518 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  23.72 
 
 
534 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1762  apolipoprotein N-acyltransferase  23.05 
 
 
527 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  25.67 
 
 
497 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  23.6 
 
 
535 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  24.6 
 
 
500 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  24.47 
 
 
506 aa  65.9  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3832  apolipoprotein N-acyltransferase  23.11 
 
 
552 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.826992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>