121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0972 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0972  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat domain protein  100 
 
 
415 aa  825    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0921  ankyrin repeat-containing protein  55.99 
 
 
412 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.122961  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1180  ankyrin repeat-containing protein  57.58 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0851  ankyrin repeat-containing protein  55.61 
 
 
408 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0978  ankyrin repeat-containing protein  44.13 
 
 
369 aa  270  4e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.90033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1407  hypothetical protein  42.06 
 
 
403 aa  263  4e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00365871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1417  ankyrin repeat-containing protein  37.67 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0333527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0764  ankyrin  26.22 
 
 
407 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0984  ankyrin repeat-containing protein  45.56 
 
 
98 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.876566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  32.2 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  27.72 
 
 
2171 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  40 
 
 
870 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 
1030 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  27.44 
 
 
483 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  31.29 
 
 
321 aa  57.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  26.76 
 
 
237 aa  56.6  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  41.49 
 
 
1402 aa  55.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  28.66 
 
 
1133 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  29.51 
 
 
545 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  26.79 
 
 
762 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  30.69 
 
 
1249 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  25.99 
 
 
469 aa  53.9  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  30.43 
 
 
711 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  30.16 
 
 
224 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  32.47 
 
 
483 aa  53.1  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  31.82 
 
 
891 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  26.38 
 
 
1585 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_002978  WD0035  ankyrin repeat-containing protein  32.41 
 
 
288 aa  52.4  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  28.57 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  32.43 
 
 
821 aa  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  27.87 
 
 
187 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  24.71 
 
 
187 aa  51.6  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  27.24 
 
 
2122 aa  50.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  26.43 
 
 
1156 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  27.16 
 
 
756 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  36.46 
 
 
194 aa  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  32.94 
 
 
247 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  29.01 
 
 
217 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  39.58 
 
 
249 aa  50.1  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  27.46 
 
 
533 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  31.36 
 
 
1061 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  29.13 
 
 
723 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  27.94 
 
 
162 aa  49.3  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  34.26 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  25.93 
 
 
151 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  30.66 
 
 
144 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  28.38 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  40 
 
 
1005 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  32.09 
 
 
640 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1317  hypothetical protein  25.37 
 
 
536 aa  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  32.35 
 
 
544 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0099  Ankyrin  34.74 
 
 
230 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5207100000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  44.07 
 
 
731 aa  47.4  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  27.07 
 
 
382 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  30.77 
 
 
227 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1154  ankyrin repeat-containing protein  36.63 
 
 
440 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  35.44 
 
 
218 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  33.33 
 
 
223 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  26.95 
 
 
157 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  30 
 
 
156 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  24.82 
 
 
1099 aa  47  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  28.5 
 
 
4520 aa  46.6  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  29.32 
 
 
542 aa  46.6  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  30 
 
 
156 aa  46.6  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  31.82 
 
 
715 aa  46.6  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  29.29 
 
 
490 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08092  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
1356 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278617  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  27.34 
 
 
855 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_002978  WD0073  ankyrin repeat-containing protein  38.67 
 
 
800 aa  45.8  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0286  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  28.95 
 
 
196 aa  46.2  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0897  ankyrin  48.98 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130242  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  25.98 
 
 
1101 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  33.33 
 
 
257 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  26.49 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  38.27 
 
 
790 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0989  Ankyrin  32.18 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  27.11 
 
 
161 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  34.94 
 
 
329 aa  45.8  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  25.36 
 
 
274 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  30 
 
 
156 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1452  predicted protein  25.62 
 
 
493 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0338335  normal  0.137357 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  27.38 
 
 
865 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  28.74 
 
 
253 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  32.03 
 
 
234 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02797  NACHT and Ankyrin domain protein (JCVI)  28.99 
 
 
1579 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.131721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  25.57 
 
 
236 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  26.76 
 
 
210 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  25.57 
 
 
236 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  34.67 
 
 
223 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  27.39 
 
 
450 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  25.57 
 
 
236 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  29.76 
 
 
173 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  24.49 
 
 
222 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3255  ankyrin  25.74 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  28.03 
 
 
472 aa  44.3  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1395  Ankyrin  46.67 
 
 
368 aa  44.3  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  25.86 
 
 
236 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  28.4 
 
 
225 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  27.54 
 
 
210 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  28.57 
 
 
261 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>