165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0585 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0585  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  488  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0123601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0778  hypothetical protein  37.85 
 
 
255 aa  156  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0983572  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1029  hypothetical protein  37.85 
 
 
255 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1091  hypothetical protein  37.85 
 
 
255 aa  155  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1431  hypothetical protein  34.91 
 
 
236 aa  118  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0038074  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0094  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2  33.8 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0292624  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0981  hypothetical protein  32.07 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1269  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  40.43 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1691  Mg2+ transporter protein, CorA-like  45.05 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0599  Mg2 transporter protein CorA family protein  41.03 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0357357  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0554  Mg2 transporter protein CorA family protein  39.74 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.836799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0748  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.33 
 
 
339 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1498  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  21.34 
 
 
331 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2765  Mg2+ transporter protein, CorA-like  30.88 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530196  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6749  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.88 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5567  Mg2 transporter protein CorA family protein  45.1 
 
 
356 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5383  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.43 
 
 
361 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.600829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2617  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.05 
 
 
342 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0423  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.43 
 
 
357 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.515411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0396  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  30.43 
 
 
342 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107708  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0488  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.05 
 
 
342 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0462  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.73 
 
 
342 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.939947 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3578  Mg2+ transporter protein, CorA-like  30.43 
 
 
372 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0549  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.43 
 
 
362 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0985  divalent cation transporter  33.33 
 
 
331 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1067  CorA family protein  28.72 
 
 
340 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0361  Mg2+/Co2+ transporter  28.72 
 
 
340 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1643  Mg2+/Co2+ transporter  28.72 
 
 
340 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1224  Mg2+/Co2+ transporter  28.72 
 
 
340 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297825  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2904  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.19 
 
 
370 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407019  normal  0.898383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0613  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.31 
 
 
346 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0226  CorA family protein  27.27 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0933777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4020  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.88 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0057  Mg2+/Co2+ transporter  27.27 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1732  Mg2+ and Co2+ transporters  30.43 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2010  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.59 
 
 
347 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.313618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3618  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.54 
 
 
362 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000031468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4318  Mg2+ transporter protein, CorA-like  28.99 
 
 
340 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2960  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.89 
 
 
315 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0634853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3048  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.76 
 
 
347 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0102286  normal  0.474894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2126  hypothetical protein  29.49 
 
 
375 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0457  Mg2 transporter protein CorA family protein  48.84 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  40.79 
 
 
363 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2415  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.59 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0770496  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3656  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.33 
 
 
321 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000861188  hitchhiker  0.00000222917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1851  Mg2 transporter protein CorA family protein  23.88 
 
 
342 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0103716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0654  Mg2 transporter protein, CorA family protein  34.33 
 
 
325 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000466682  normal  0.097367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0790  Mg2+ transporter  34.33 
 
 
325 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000404579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1603  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.3 
 
 
331 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  decreased coverage  0.000000000150807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3715  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.33 
 
 
325 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000111951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3838  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.33 
 
 
321 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000270616  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0655  Mg2 transporter protein, CorA family protein  34.33 
 
 
325 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194891  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3367  Mg2 transporter protein, CorA family protein  34.33 
 
 
325 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00335371  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0681  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  34.33 
 
 
330 aa  52.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04870  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  30.77 
 
 
339 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0800  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.87 
 
 
344 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3701  cation transporter, putative  27.54 
 
 
339 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2908  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  32.1 
 
 
321 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000151397  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.03 
 
 
355 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2558  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.53 
 
 
342 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1774  Mg2+ transporter protein, CorA-like  26.09 
 
 
355 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1278  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.21 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0707161  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3316  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.26 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2085  cmaX protein  28.79 
 
 
332 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10467  normal  0.016656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2530  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.52 
 
 
326 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0783252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3655  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  28.79 
 
 
331 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561597  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2609  zinc transporter  22.77 
 
 
327 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.590272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0125  magnesium transporter, putative  33.33 
 
 
322 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3530  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.18 
 
 
357 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203134  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1736  Mg2+ transporter protein, CorA-like  36.67 
 
 
330 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0741818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2621  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  31.15 
 
 
324 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.533199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40270  putative cation transporter  29.51 
 
 
340 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611519  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1596  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.79 
 
 
331 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180854  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3984  magnesium transporter, putative  31.34 
 
 
321 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0618  Mg2 transporter protein, CorA family protein  28.17 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2647  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  29.17 
 
 
325 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0326  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.18 
 
 
409 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0389  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  33.78 
 
 
375 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.3 
 
 
322 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0379  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.7 
 
 
397 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  32.43 
 
 
354 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  32.43 
 
 
354 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1906  Mg2+/Co+2/Zn+2 transporter, CorA-like  30.88 
 
 
339 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.41 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.25 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0018  Mg2 transporter protein CorA family protein  21.2 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000124809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0134  magnesium/cobalt transporter CorA  29.2 
 
 
317 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000744017  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0305  transport protein  35.38 
 
 
366 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0423959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1958  Mg2 transporter protein CorA family protein  41.54 
 
 
310 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000232842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0373  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.1 
 
 
360 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000133876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4137  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.9 
 
 
322 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  hitchhiker  0.000000000148264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3533  hypothetical protein  27.69 
 
 
332 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.51 
 
 
390 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41630  putative cytoplasmic membrane-associated protein  27.38 
 
 
332 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2318  zinc transporter  21.43 
 
 
327 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2600  zinc transporter  21.43 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1034  magnesium and cobalt transporter, putative  38.46 
 
 
310 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00652264  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2830  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  35.29 
 
 
320 aa  45.8  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2858  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  26.76 
 
 
305 aa  45.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0228802  normal  0.0235683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.57 
 
 
353 aa  45.4  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>