More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0428 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0428  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 204 aa  384  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0182  amino acid transporter LysE  60.1 
 
 		 205 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46450  Transporter, LysE family  49.5 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3513  lysine exporter protein LysE/YggA  50.26 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0702628  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3653  amino acid transporter LysE  50.74 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2077  lysine exporter protein LysE/YggA  50.74 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3736  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.66 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2250  lysine exporter protein LysE/YggA  50.5 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.233575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2254  lysine exporter protein LysE/YggA  51.83 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.675856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7985  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.15 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3990  lysine exporter protein LysE/YggA  43.2 
 
 		 216 aa  138  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3769  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.39 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0070  lysine exporter protein LysE/YggA  44.93 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3659  lysine exporter protein LysE/YggA  38.86 
 
 		 233 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  37 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  28.5 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  31.84 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  31.84 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  31.84 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0849  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  31.34 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  33.94 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  33.33 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  33.94 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  33.94 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  33.94 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  28.43 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  35.19 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  36.8 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2805  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.34 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0971  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.32 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.84 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0589  lysine exporter protein LysE/YggA  30.61 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  28.85 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.78 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  31.95 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  38.56 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  37.21 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.6 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4486  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.96 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  29.05 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.08 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.84 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  29.52 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4170  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.58 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319888  normal  0.802735 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.16 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0074  LysE family amino acid efflux protein  36.5 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.16 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.28 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  29.76 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6040  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.78 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.04 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  30.54 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  30.54 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.54 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.54 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  30.34 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.14 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  30.54 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  37.86 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.54 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.7 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  38.73 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.54 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.54 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.14 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.58 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  32.92 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0116  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.64 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.83 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179524  hitchhiker  0.00000160159 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.5 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  35.37 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>