229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07510 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_07510  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  330  5e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0112753  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  67.88 
 
 
165 aa  237  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  61.82 
 
 
165 aa  214  5e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  60.61 
 
 
165 aa  213  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 
165 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  43.03 
 
 
165 aa  145  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  44.85 
 
 
164 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  45.45 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  46.06 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  138  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  138  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  138  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  138  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 
166 aa  138  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 
163 aa  134  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  46.11 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  46.25 
 
 
161 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  41.25 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  41.25 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 
163 aa  130  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  41.61 
 
 
160 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  127  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  40.99 
 
 
161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  44.38 
 
 
161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  124  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  46.01 
 
 
163 aa  124  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  43.9 
 
 
164 aa  124  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  41.32 
 
 
165 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  40.72 
 
 
165 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  40.62 
 
 
164 aa  122  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  45.18 
 
 
165 aa  121  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  46.01 
 
 
162 aa  121  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  45.24 
 
 
167 aa  120  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  42.51 
 
 
165 aa  120  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  37.27 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  37.27 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  37.27 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  39.13 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  40.99 
 
 
159 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
161 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  36.02 
 
 
163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  36.65 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
164 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  38.12 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  38.12 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  37.27 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  38.75 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  42.17 
 
 
163 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  39.75 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  38.51 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  44.58 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  38.79 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  39.76 
 
 
164 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 
163 aa  113  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0203  putative nucleotide-binding protein  39.13 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1993  putative nucleotide-binding protein  39.13 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0973999  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  41.1 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1539  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1649  putative nucleotide-binding protein  37.58 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  42.94 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  38.41 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  38.12 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  38.51 
 
 
161 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  36.65 
 
 
160 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  39.13 
 
 
160 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  43.98 
 
 
163 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  37.89 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  39.75 
 
 
159 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>