20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04260 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04260  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  946    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0731  hypothetical protein  57.69 
 
 
573 aa  507  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0733  hypothetical protein  30.03 
 
 
350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.97575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  29.31 
 
 
861 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  27.27 
 
 
345 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  23.25 
 
 
346 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  23.45 
 
 
247 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  33.33 
 
 
875 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  26.61 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  37.97 
 
 
1195 aa  48.5  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  31.45 
 
 
339 aa  47.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  36.45 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  35.79 
 
 
342 aa  44.3  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  37.5 
 
 
355 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  27.11 
 
 
318 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  25 
 
 
862 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  25.47 
 
 
344 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  38.2 
 
 
773 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  50.98 
 
 
313 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  35.06 
 
 
333 aa  43.5  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>