17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02960 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_02960  phage recombination protein Bet  100 
 
 		 224 aa  466  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000371623  hitchhiker  1.14884e-46 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1235  phage recombination protein Bet  33.7 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2416  phage recombination protein Bet  31.8 
 
 		 377 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.110715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0590  phage recombination protein Bet  27.41 
 
 		 327 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1112  recombination protein bet  25.75 
 
 		 261 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.104209  normal  0.366414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0805  phage recombination protein Bet  25.75 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501424  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10013  bet  25.75 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3241  phage recombination protein Bet  25.75 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  hitchhiker  0.00000845343 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3564  phage recombination protein Bet  25.75 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0102109  hitchhiker  5.30303e-19 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00713  hypothetical protein  25.75 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0056  phage recombination protein Bet  26.47 
 
 		 312 aa  48.5  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00827419  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2876  phage recombination protein Bet  25.45 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00954022  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0884  recombination protein bet  26.85 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2931  phage recombination protein Bet  25.15 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321205  decreased coverage  3.3595200000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1883  phage recombination protein Bet  28.38 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0851  putative prophage LambdaCh01, recombination protein Bet  29.27 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000847263  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0399  phage recombination protein Bet  25.55 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0845038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>