15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3065 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3065  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  381  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1189  hypothetical protein  61.08 
 
 
185 aa  235  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000115787  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1038  hypothetical protein  60.61 
 
 
185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0619516  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1057  hypothetical protein  60.61 
 
 
185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.282442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0376  hypothetical protein  56.42 
 
 
182 aa  187  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000043617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2858  hypothetical protein  55.87 
 
 
182 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914413  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1472  hypothetical protein  55.25 
 
 
198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1101  hypothetical protein  54.1 
 
 
190 aa  182  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000139057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1233  hypothetical protein  57.49 
 
 
186 aa  174  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272813  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1410  hypothetical protein  39.46 
 
 
195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1207  hypothetical protein  32.24 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0553382  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1204  hypothetical protein  27.22 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.601718  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1824  hypothetical protein  27.22 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1178  hypothetical protein  27.53 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.446218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3415  hypothetical protein  26.46 
 
 
228 aa  45.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.00123882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>