More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2706 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2626  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
118 aa  243  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1835  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
118 aa  243  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000170818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2969  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
118 aa  243  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0106033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2706  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
118 aa  243  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0242768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0516  IS66 Orf2 like  69.57 
 
 
118 aa  177  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000107243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2202  IS66 Orf2 like  47.86 
 
 
117 aa  126  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2210  IS66 Orf2 like  47.86 
 
 
117 aa  126  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.584278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2282  IS66 Orf2 like  45.3 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.915115  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3053  IS66 Orf2 family protein  53.47 
 
 
109 aa  123  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1009  IS66 Orf2 family protein  45.76 
 
 
118 aa  123  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0576  IS66 Orf2 family protein  44.92 
 
 
118 aa  122  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0274  IS66 Orf2 family protein  44.07 
 
 
118 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1438  IS66 Orf2 family protein  44.17 
 
 
120 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2983  IS66 Orf2 family protein  51.49 
 
 
109 aa  120  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0150  IS66 Orf2 family protein  44.07 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000176668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1020  IS66 Orf2 family protein  44.07 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2338  IS66 Orf2 like  50 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0703  IS66 Orf2 family protein  47.57 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000158593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0202  IS66 Orf2 family protein  47.57 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00976284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0639  IS66 Orf2 family protein  44.86 
 
 
114 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0611  IS66 Orf2 family protein  44.86 
 
 
114 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  40.43 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4533  IS66 Orf2 family protein  37.61 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1535  IS66 Orf2 family protein  44.21 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1784  IS66 Orf2 family protein  44.21 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6839  IS66 Orf2 family protein  40.38 
 
 
116 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6339  IS66 Orf2 family protein  39.36 
 
 
117 aa  90.5  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  42.71 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2522  IS66 Orf2 family protein  36.79 
 
 
117 aa  87.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6578  IS66 Orf2 family protein  40.82 
 
 
116 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1004  IS66 Orf2 family protein  45.16 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1617  IS66 Orf2 family protein  45.16 
 
 
119 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.841823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  44.79 
 
 
118 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  44.79 
 
 
118 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  44.79 
 
 
118 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4092  ISPpu15, transposase Orf1  44.55 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.749928  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  40.7 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0521  IS66 Orf2 family protein  44.55 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1718  IS66 Orf2 family protein  44.55 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4793  IS66 Orf2 family protein  44.55 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4024  ISPpu15, transposase Orf1  44.55 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4746  ISPpu15, transposase Orf1  44.55 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237213  hitchhiker  0.00598582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3221  ISPsy5, Orf1  44.55 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0651987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3966  ISPsy5, Orf1  43.56 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343547  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0065  transposase  40.57 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1275  IS66 Orf2 like  40.57 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0748558  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0638  ISPpu15, transposase Orf1  45.83 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0036  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0040  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0197  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0669  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0842  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1017  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1019  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1099  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1190  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1226  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2436  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2461  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0245256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2839  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00396597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2885  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2970  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0658075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3212  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.071716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3215  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3612  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3652  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3997  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3998  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4252  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4390  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4566  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4694  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4738  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0621301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4765  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4995  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5213  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5214  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5305  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5367  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.450388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5412  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5444  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5544  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5590  ISPsy5, Orf1  41.96 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  43.37 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  39.6 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0143  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1257  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0290  transposase  41.35 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0436  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0316  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0165455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1292  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.035818  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0515  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0215  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1240  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0999  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0114  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0896  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1279  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.507833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0235  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.800735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0280  transposase  40.4 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>