47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1522 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1522  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.183332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0559  single-stranded DNA-binding protein  74.16 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2188  single-stranded DNA-binding protein  60.48 
 
 		 215 aa  278  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2166  single-stranded DNA-binding protein  58.06 
 
 		 218 aa  268  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000374562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1877  single-stranded DNA-binding protein  61.39 
 
 		 218 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000367804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1460  single-stranded DNA-binding protein  58.1 
 
 		 214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3483  single-stranded DNA-binding protein  56.1 
 
 		 211 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000160494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  28.69 
 
 		 161 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  32.53 
 
 		 119 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  39.47 
 
 		 168 aa  53.1  0.000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 169 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  35 
 
 		 146 aa  52  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  32.71 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  30.28 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  30.28 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  27.17 
 
 		 134 aa  48.5  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 140 aa  48.5  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  29.82 
 
 		 141 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  33.73 
 
 		 114 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  32 
 
 		 125 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  32 
 
 		 125 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  31.63 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  27.5 
 
 		 136 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  34.18 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1869  single-strand binding protein  27.1 
 
 		 129 aa  46.2  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  25.78 
 
 		 139 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  31.33 
 
 		 164 aa  45.1  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  31.33 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  32.53 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  31.33 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  31.33 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  31.33 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  31.33 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  31.33 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  31.33 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  31.33 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  28.33 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  32.5 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  32.5 
 
 		 173 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  31.33 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 141 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 142 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  32 
 
 		 154 aa  42  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 142 aa  42  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 142 aa  42  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  26.09 
 
 		 161 aa  42  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>