13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0694 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0694  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  530  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3255  nitroreductase  34.63 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1598  nitroreductase  39.61 
 
 
224 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1206  hypothetical protein  25.58 
 
 
206 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000154842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1249  hypothetical protein  25.58 
 
 
206 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1558  nitroreductase  26.03 
 
 
287 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000161675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2590  nitroreductase  25.78 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1049  hypothetical protein  25.97 
 
 
265 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.56 
 
 
176 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3093  hypothetical protein  22.09 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  26.35 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06530  nitroreductase family protein  21.14 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000696704  normal  0.412825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  34.21 
 
 
318 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>