More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_R0038 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_R0041  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.239536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0038  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0041  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0004  tRNA-Ala  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.892843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0007  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0020  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.530354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0020  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0048  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.544704  hitchhiker  0.00053111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0056  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0061  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0041  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0031  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0021  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.984556  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0050  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0058  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0063  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0015  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0042  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.333285 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0051  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0061  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.842258  normal  0.752535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0008  tRNA-Ala  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.532547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0027  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285298  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0054  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0070  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.756512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0047  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0015    90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.348297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0030  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0041  tRNA-Ala  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0020  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0012  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0053  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0020  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.844212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0063  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124606  normal  0.113199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0010  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.021677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0068  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0015  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0053  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.4871  normal  0.314649 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0056  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0004  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0038  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309140  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309089  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309163  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0011  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309372  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.272937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0020  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309204  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72887  normal  0.842293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0019  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.399377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0037  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0008  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0953331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0032  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.168105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0037  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0051  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0031  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044944  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0002  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309290  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0021  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000106448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0034  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000564918  normal  0.218531 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0009  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000731062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0013  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0036  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0006  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0860739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0011  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.193139  normal  0.133058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0004  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0014  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0037  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0014  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309282  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127609 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0041  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0709552  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0027  tRNA-Ala  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0008  tRNA-Ala  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00250215  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0025  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0005  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314904 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0001  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0005  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0018  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0308139  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0010  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.407573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0010  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057492  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0046  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0258027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0051  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00326143  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt13  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0344586  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1330  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0700  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3541  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000166638  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000191328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1989  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000370393  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0927  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000140839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0003  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000586808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1475  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000234459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3560  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000184914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0005  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000294423  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0496  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554193  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2045  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1098  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000248852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2896  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000192555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3093  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502528  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3567  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488975  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0063  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000409772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>