38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_R0019 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_R0019  tRNA-Tyr  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164183  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0009  tRNA-Tyr  94.05 
 
 		 83 bp  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0028  tRNA-Tyr  94.05 
 
 		 83 bp  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0846245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0007  tRNA-Tyr  92.86 
 
 		 83 bp  111  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0265739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0058  tRNA-Tyr  92.86 
 
 		 82 bp  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0056  tRNA-Tyr  92.86 
 
 		 82 bp  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467889  normal  0.980265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0021  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 83 bp  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0007  tRNA-Tyr  92.86 
 
 		 82 bp  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.737709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0054  tRNA-Tyr  92.86 
 
 		 82 bp  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  88.31 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0053  tRNA-Tyr  84.52 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122599  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0047  tRNA-Tyr  89.83 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460212  normal  0.496186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0003  tRNA-Tyr  89.83 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0003  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0002  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 86 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0027  tRNA-Tyr  83.33 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190933  normal  0.0646404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0056  tRNA-Tyr  83.33 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0037  tRNA-Tyr  90.7 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000333812  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0073  tRNA-Tyr  86.15 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.665729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0041    82.14 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA36  tRNA-Tyr  82.14 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.881031  normal  0.0480599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0042  tRNA-Tyr  82.14 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0039  tRNA-Tyr  82.14 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0010  tRNA-Tyr  87.27 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  85.19 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  85.19 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0054  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122077 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  83.33 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0006  tRNA-Tyr  86.96 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>