59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5321 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5321  putative sensory transduction regulatory protein  100 
 
 		 84 aa  167  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563131  normal  0.70291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  44.74 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2783  response regulator receiver  46.05 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  38.96 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  47.22 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  43.42 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  43.04 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  46.97 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  38.16 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  38.89 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  44.12 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  41.27 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  43.06 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  40.28 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 		 602 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2384  response regulator receiver  37.5 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00466139  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1774  response regulator receiver  38.89 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0498529  decreased coverage  0.00379005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2651  response regulator  35.53 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00566392  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  44.78 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  37.18 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  43.24 
 
 		 855 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  41.94 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  41.89 
 
 		 856 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  35.53 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  37.5 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  40 
 
 		 118 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  42.19 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  39.71 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1726  response regulator receiver protein  43.06 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  41.27 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 559 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  55.26 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  33.8 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  39.06 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  46.51 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 121 aa  42  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  39.44 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  41.79 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  46.51 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  48.72 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  34.72 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  41.79 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  35.62 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  48.15 
 
 		 126 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>