81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2274 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2274  conjugal transfer protein TrbF  100 
 
 		 228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.736535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3834  conjugal transfer protein TrbF  61.78 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3698  conjugal transfer protein TrbF  63.23 
 
 		 227 aa  288  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3858  conjugal transfer protein TrbF  60.96 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00683431  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3093  conjugal transfer protein TrbF  59.56 
 
 		 227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2093  conjugal transfer protein TrbF  58.77 
 
 		 228 aa  281  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0618543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7748  conjugal transfer protein TrbF  64.44 
 
 		 226 aa  281  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520847  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2997  conjugal transfer protein TrbF  58.67 
 
 		 227 aa  281  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0311  conjugal transfer protein TrbF  60.18 
 
 		 227 aa  279  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2831  conjugal transfer protein TrbF  58.45 
 
 		 229 aa  278  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.571124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7447  conjugal transfer protein TrbF  59.82 
 
 		 226 aa  278  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1006  conjugal transfer protein TrbF  58.67 
 
 		 226 aa  278  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2607  conjugal transfer protein TrbF  60.54 
 
 		 227 aa  277  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3993  conjugal transfer protein TrbF  59.73 
 
 		 229 aa  276  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0169499  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3219  conjugal transfer protein TrbF  58.41 
 
 		 229 aa  275  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00389999  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3201  conjugal transfer protein TrbF  59.73 
 
 		 229 aa  274  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0602  conjugal transfer protein TrbF  59.73 
 
 		 229 aa  274  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0692  conjugal transfer protein TrbF  58.41 
 
 		 229 aa  274  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3548  conjugal transfer protein TrbF  57.08 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1187  conjugal transfer protein TrbF  57.08 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2317  conjugal transfer protein TrbF  59.29 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.643073  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0502  conjugal transfer protein TrbF  59.65 
 
 		 229 aa  271  9e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0478499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3894  conjugal transfer protein TrbF  59.11 
 
 		 226 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0742  conjugal transfer protein TrbF  60 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0149  conjugal transfer protein TrbF  60.18 
 
 		 229 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1477  conjugal transfer protein TrbF  58.41 
 
 		 229 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0985827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1487  conjugal transfer protein TrbF  57.78 
 
 		 226 aa  268  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2479  conjugal transfer protein TrbF  60.99 
 
 		 227 aa  268  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.901597  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2885  conjugal transfer protein TrbF  59.56 
 
 		 227 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3371  conjugal transfer protein TrbF  58.3 
 
 		 227 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1506  conjugal transfer protein TrbF  55.56 
 
 		 227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0960  conjugal transfer protein TrbF  55.61 
 
 		 227 aa  263  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3534  conjugal transfer protein TrbF  57.53 
 
 		 227 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776312  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0168  conjugal transfer protein TrbF  57.89 
 
 		 229 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.577326  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1289  conjugal transfer protein TrbF  52.91 
 
 		 234 aa  238  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1323  conjugal transfer protein TrbF  52.21 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3699  conjugal transfer protein TrbF  52.47 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30870  conjugal transfer protein TrbF  52.47 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177985  unclonable  2.25295e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1902  conjugal transfer protein TrbF  52.02 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.617323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1348  conjugal transfer protein TrbF  52.02 
 
 		 234 aa  234  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000109379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2577  conjugal transfer protein TrbF  51.57 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.756433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2011  conjugal transfer protein TrbF  51.57 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264252  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1557  conjugal transfer protein TrbF  52.02 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000776204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0733  conjugal transfer protein TrbF  51.12 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2692  conjugal transfer protein TrbF  49.56 
 
 		 234 aa  231  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0792392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2651  conjugal transfer protein TrbF  50.22 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0552472  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0431  conjugal transfer protein TrbF  50.22 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2904  conjugal transfer protein TrbF  50.22 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.071912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4201  conjugal transfer protein TrbF  51.15 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.902696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2357  conjugal transfer protein TrbF  50.88 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.109686  normal  0.258524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3499  conjugal transfer protein TrbF  49.78 
 
 		 234 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35650  conjugal transfer protein TrbF  49.78 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109489  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1841  conjugal transfer protein TrbF  50.23 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.377716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2033  conjugal transfer protein TrbF  46.61 
 
 		 261 aa  208  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1146  conjugal transfer protein TrbF  43.05 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5369  conjugal transfer protein TrbF  36.28 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682768  normal  0.410714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2345  Conjugal transfer protein  37.28 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5216  conjugal transfer protein TrbF  37.67 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2353  Conjugal transfer protein  34.58 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.744768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1713  Conjugal transfer protein  32.86 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000549304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5489  conjugal transfer protein TrbF  32.08 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8326  conjugal transfer protein TrbF  31.34 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.029334  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9260  conjugal transfer protein TrbF  31.8 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399754  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4562  conjugal transfer protein TrbF  29.25 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5383  conjugal transfer protein TrbF  30.41 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0583323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2509  conjugal transfer protein  30.52 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.385646  normal  0.64897 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6506  conjugal transfer protein TrbF  31.2 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4270  conjugal transfer protein TrbF  30.77 
 
 		 260 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117817  normal  0.0324718 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6631  conjugal transfer protein TrbF  30.77 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1665  Conjugal transfer protein  29.07 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9651  conjugal transfer protein TrbF  27.49 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39699  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1694  conjugal transfer protein  27.19 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194664  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1392  conjugal transfer protein  27.19 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0051  conjugal transfer protein TrbF  28.87 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0256  conjugal transfer protein  27.65 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2229  conjugal transfer protein TrbF  25 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.373405  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4695  conjugal transfer protein TrbF  23.5 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1084  conjugal transfer protein  54.17 
 
 		 56 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2824  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  23.12 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4754  hypothetical protein  23.56 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.26139 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5457  Type IV secretory pathway component VirB8-like  20.56 
 
 		 256 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0195796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>