19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1597 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1597    100 
 
 
1159 bp  2298    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3709  low termperature growth protein  95.24 
 
 
1191 bp  101  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.848697  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0230  hypothetical protein  90.32 
 
 
1197 bp  75.8  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1638  low temperature requirement A  84.21 
 
 
1134 bp  69.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2001  low temperature requirement A  92 
 
 
756 bp  67.9  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1068  low temperature requirement A  86.3 
 
 
1194 bp  65.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2023  low temperature requirement A  90.57 
 
 
1191 bp  65.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226611  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1595  low temperature requirement A  91.67 
 
 
1113 bp  63.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.622684  normal  0.393956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2141  low temperature requirement A  95 
 
 
1173 bp  63.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2245  low temperature requirement A  90 
 
 
1191 bp  60  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0087    86.15 
 
 
831 bp  58  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0079  low temperature requirement A  88.46 
 
 
1194 bp  56  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1756  low temperature requirement A  85.71 
 
 
1191 bp  54  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5396  hypothetical protein  88 
 
 
1203 bp  52  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5996  low temperature requirement A  92.11 
 
 
1245 bp  52  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.322871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2495  low temperature requirement A  90.24 
 
 
1224 bp  50.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4271  low temperature requirement A  90.24 
 
 
1164 bp  50.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1999  membrane protein-like protein  100 
 
 
711 bp  48.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  96.43 
 
 
1671 bp  48.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>