32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0003 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000176947  hitchhiker  0.0000474018 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08860  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00968271  normal  0.0225487 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1397  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0049  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0050  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0007  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0009  tRNA-Arg  87.69 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.29751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0039  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265352  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0008  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0713  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13110  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0488167  normal  0.646736 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t09  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.146869  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19600  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0042  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802869 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0067  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0638  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.737204  normal  0.415915 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0241  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.628692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0582  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0081  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5013  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4647  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.695666  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0018  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00007  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0029  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0036  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.224199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0033  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0771272  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0051  tRNA-Arg  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  91.18 
 
 		 1137 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>