42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2465 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2465  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  848    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.139636  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
501 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  25.62 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  25.29 
 
 
510 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
506 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  26.46 
 
 
499 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  29.6 
 
 
504 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
530 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 
506 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  24.21 
 
 
497 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  26.37 
 
 
494 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  26.09 
 
 
505 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  25.68 
 
 
511 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  21.62 
 
 
508 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  18.98 
 
 
514 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  22.49 
 
 
516 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 
497 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  27.41 
 
 
510 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  18.75 
 
 
514 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  19.58 
 
 
503 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 
515 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  24.91 
 
 
520 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  21.57 
 
 
503 aa  50.4  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  23.23 
 
 
512 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  18.3 
 
 
509 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.45 
 
 
501 aa  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  22.53 
 
 
512 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  22.18 
 
 
518 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  20.76 
 
 
520 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
496 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  27.6 
 
 
505 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  28 
 
 
505 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  24.66 
 
 
504 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  20.14 
 
 
520 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  21.43 
 
 
507 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  21.05 
 
 
522 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  20.98 
 
 
506 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  21.59 
 
 
495 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  24.03 
 
 
512 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  29.52 
 
 
476 aa  43.5  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  22 
 
 
502 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  20.92 
 
 
514 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>