More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1780 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0717  phosphofructokinase  92.77 
 
 		 401 aa  760    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1600  phosphofructokinase  89.28 
 
 		 401 aa  736    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.760779 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1780  phosphofructokinase  100 
 
 		 401 aa  822    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000506993  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0550  6-phosphofructokinase  83.29 
 
 		 401 aa  716    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000101268  normal  0.239253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0589  6-phosphofructokinase  90.77 
 
 		 401 aa  741    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0608  phosphofructokinase  84.54 
 
 		 401 aa  719    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000647644  decreased coverage  0.00336631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  34.05 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  30.93 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  32.84 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  33.33 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  32.21 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  32.65 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  32.69 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.77 
 
 		 346 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  31.9 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 344 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  32.98 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  29.7 
 
 		 364 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  30.13 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  30.56 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  34.81 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  31.27 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  34.24 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  32.02 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  31.41 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  34.83 
 
 		 365 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  31.31 
 
 		 362 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  29.18 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  31.87 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  30.89 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  29.67 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  32.03 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  31.49 
 
 		 341 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  30.15 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  31.08 
 
 		 368 aa  135  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  30.57 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  31.61 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  29.62 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1623  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  31.72 
 
 		 341 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  32.33 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  31.48 
 
 		 341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  30.5 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  30.46 
 
 		 363 aa  133  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  29.82 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  30.15 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  29.78 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  30.5 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  30.09 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  30.81 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  30.96 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  29.51 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  30.52 
 
 		 341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  29.83 
 
 		 345 aa  129  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  30.52 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  31.07 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  29.95 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  31.07 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  31.07 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  33.5 
 
 		 355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  29.4 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  30.79 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  29.43 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.77 
 
 		 349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  29.82 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  31.04 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  30.08 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1263  6-phosphofructokinase  30.84 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  30.2 
 
 		 368 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  28.11 
 
 		 351 aa  123  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  28.93 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  28.65 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  31.67 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  29.68 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  31.67 
 
 		 319 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  28.43 
 
 		 358 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  27.27 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  31.65 
 
 		 360 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  27.82 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  28.93 
 
 		 385 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  31.65 
 
 		 360 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  27.27 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  36.21 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  28.18 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  28.68 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0592  6-phosphofructokinase  30.56 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00575817  normal  0.643142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  28.68 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  30.39 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  27.13 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  30.26 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3015  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  29.19 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  32.75 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  31.9 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03801  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4069  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4395  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5370  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4102  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4449  6-phosphofructokinase  29.06 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03750  hypothetical protein  29.06 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>