More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0314 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00746  excinuclease ABC subunit B  54.17 
 
 		 673 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000144798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2863  excinuclease ABC, B subunit  54.17 
 
 		 673 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0441  excinuclease ABC subunit B  52.9 
 
 		 668 aa  710    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3262  excinuclease ABC subunit B  55.01 
 
 		 664 aa  728    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1974  excinuclease ABC subunit B  54.02 
 
 		 671 aa  719    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.238105  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_002950  PG0380  excinuclease ABC subunit B  55.11 
 
 		 678 aa  750    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1369  excinuclease ABC subunit B  49.78 
 
 		 662 aa  678    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0426  excinuclease ABC subunit B  54.46 
 
 		 661 aa  736    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2201  excinuclease ABC subunit B  54.05 
 
 		 664 aa  698    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1011  excinuclease ABC subunit B  51.7 
 
 		 696 aa  695    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.771852  normal  0.613992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5272  excinuclease ABC subunit B  56.34 
 
 		 658 aa  762    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2887  excinuclease ABC subunit B  50.9 
 
 		 673 aa  684    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1464  excinuclease ABC subunit B  52.8 
 
 		 663 aa  741    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1512  excinuclease ABC subunit B  51.19 
 
 		 940 aa  684    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2506  excinuclease ABC subunit B  53.4 
 
 		 673 aa  721    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2164  excinuclease ABC, B subunit  54.68 
 
 		 671 aa  722    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5016  excinuclease ABC subunit B  56.95 
 
 		 658 aa  772    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4845  excinuclease ABC subunit B  57.1 
 
 		 658 aa  773    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4860  excinuclease ABC subunit B  56.95 
 
 		 658 aa  771    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0880  excinuclease ABC subunit B  50.98 
 
 		 696 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0086  excinuclease ABC subunit B  52.53 
 
 		 663 aa  693    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0074  excinuclease ABC subunit B  52.68 
 
 		 663 aa  694    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1974  excinuclease ABC subunit B  54.53 
 
 		 671 aa  720    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.292507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2003  excinuclease ABC subunit B  51.27 
 
 		 690 aa  689    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1196  excinuclease ABC subunit B  53.34 
 
 		 701 aa  711    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1247  excinuclease ABC subunit B  52.92 
 
 		 678 aa  712    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1051  excinuclease ABC subunit B  52.54 
 
 		 695 aa  693    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2708  excinuclease ABC subunit B  50.6 
 
 		 670 aa  682    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.624611  normal  0.0488404 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1568  excinuclease ABC subunit B  52.75 
 
 		 675 aa  713    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4680  excinuclease ABC subunit B  54.04 
 
 		 665 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1920  excinuclease ABC subunit B  50.98 
 
 		 707 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1139  excinuclease ABC subunit B  53.36 
 
 		 687 aa  685    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0652505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1875  excinuclease ABC subunit B  53.87 
 
 		 671 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0099  excinuclease ABC subunit B  54.63 
 
 		 667 aa  723    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5538  excinuclease ABC subunit B  51.27 
 
 		 707 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0391  excinuclease ABC subunit B  82.96 
 
 		 695 aa  1139    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.301443  normal  0.603789 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0077  excinuclease ABC subunit B  52.06 
 
 		 679 aa  696    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.5939  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0314  excinuclease ABC subunit B  100 
 
 		 681 aa  1387    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0080  excinuclease ABC subunit B  52.95 
 
 		 702 aa  717    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.935466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3219  excinuclease ABC subunit B  55.29 
 
 		 665 aa  731    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0533109  hitchhiker  0.000839421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2096  excinuclease ABC subunit B  53.01 
 
 		 682 aa  701    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.587064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1754  excinuclease ABC subunit B  52.41 
 
 		 678 aa  721    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5396  excinuclease ABC subunit B  56.95 
 
 		 658 aa  772    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1741  excinuclease ABC subunit B  52.88 
 
 		 679 aa  726    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0563  excinuclease ABC subunit B  55.52 
 
 		 666 aa  741    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.733421  normal  0.043063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1361  excinuclease ABC subunit B  51.41 
 
 		 695 aa  688    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0251  excinuclease ABC subunit B  56.16 
 
 		 663 aa  737    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2036  excinuclease ABC subunit B  50.98 
 
 		 696 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1275  excinuclease ABC subunit B  54.11 
 
 		 699 aa  726    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1626  excinuclease ABC subunit B  52.16 
 
 		 714 aa  685    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1162  excinuclease ABC subunit B  52.24 
 
 		 642 aa  691    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.206344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2175  excinuclease ABC subunit B  52.37 
 
 		 710 aa  680    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00395254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1753  excinuclease ABC subunit B  53.52 
 
 		 666 aa  717    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1320  excinuclease ABC subunit B  51.27 
 
 		 679 aa  702    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.350926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2176  excinuclease ABC subunit B  51.18 
 
 		 706 aa  677    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00882926  normal  0.14877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3153  excinuclease ABC subunit B  50.97 
 
 		 701 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1797  excinuclease ABC subunit B  51.92 
 
 		 676 aa  701    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000373442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2303  excinuclease ABC subunit B  52.25 
 
 		 660 aa  688    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1833  excinuclease ABC subunit B  52.58 
 
 		 676 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1019  excinuclease ABC subunit B  51.95 
 
 		 697 aa  689    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231406  normal  0.390908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1782  excinuclease ABC subunit B  54.67 
 
 		 662 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.753339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1890  excinuclease ABC subunit B  51.05 
 
 		 676 aa  674    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.570377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0144  excinuclease ABC subunit B  50.37 
 
 		 730 aa  674    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00842263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0275  excinuclease ABC subunit B  51.34 
 
 		 728 aa  673    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5867  excinuclease ABC subunit B  50.67 
 
 		 707 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3001  excinuclease ABC subunit B  52.1 
 
 		 719 aa  704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2963  excinuclease ABC subunit B  51.94 
 
 		 669 aa  697    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0008  excinuclease ABC subunit B  54.11 
 
 		 673 aa  757    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.847114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0300  excinuclease ABC subunit B  53.66 
 
 		 659 aa  750    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0295  excinuclease ABC subunit B  53.81 
 
 		 659 aa  750    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.837943  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1617  excinuclease ABC subunit B  53.46 
 
 		 677 aa  711    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2678  excinuclease ABC subunit B  52.58 
 
 		 677 aa  712    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.292307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2061  excinuclease ABC subunit B  52.96 
 
 		 673 aa  721    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000836148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1914  excinuclease ABC subunit B  53.11 
 
 		 673 aa  722    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00112158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1088  excinuclease ABC subunit B  53.2 
 
 		 675 aa  690    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2170  excinuclease ABC subunit B  51.78 
 
 		 673 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00276805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0251  excinuclease ABC subunit B  55.13 
 
 		 665 aa  723    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00546906  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2248  excinuclease ABC subunit B  51.12 
 
 		 696 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23510  excinuclease ABC subunit B  54.3 
 
 		 670 aa  707    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0583  excinuclease ABC subunit B  50.78 
 
 		 692 aa  728    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0372  excinuclease ABC subunit B  52.79 
 
 		 673 aa  735    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1318  excinuclease ABC subunit B  51.41 
 
 		 671 aa  739    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000791691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0392  excinuclease ABC subunit B  51.92 
 
 		 669 aa  736    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1457  excinuclease ABC subunit B  51.85 
 
 		 668 aa  732    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2070  excinuclease ABC subunit B  52.28 
 
 		 693 aa  715    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2210  excinuclease ABC subunit B  50.67 
 
 		 707 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0801  excinuclease ABC subunit B  52.85 
 
 		 691 aa  695    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.177675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0699  excinuclease ABC subunit B  53.02 
 
 		 675 aa  725    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301254  normal  0.648791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2166  excinuclease ABC subunit B  53.25 
 
 		 673 aa  723    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000274119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1106  excinuclease ABC subunit B  53.91 
 
 		 705 aa  728    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.442429  normal  0.317752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3485  excinuclease ABC subunit B  50.57 
 
 		 701 aa  694    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2024  excinuclease ABC subunit B  80.39 
 
 		 685 aa  1117    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00725134  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2837  excinuclease ABC subunit B  52.54 
 
 		 706 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1828  excinuclease ABC subunit B  53.06 
 
 		 672 aa  707    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00277406  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3047  excinuclease ABC subunit B  52.1 
 
 		 719 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1082  excinuclease ABC subunit B  51.4 
 
 		 670 aa  691    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00208033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3350  excinuclease ABC subunit B  52.53 
 
 		 722 aa  692    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0910729  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1033  excinuclease ABC subunit B  55.01 
 
 		 685 aa  724    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.568445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1529  excinuclease ABC subunit B  54.25 
 
 		 677 aa  710    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2441  excinuclease ABC subunit B  51.64 
 
 		 696 aa  676    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.869915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>