More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8705 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8705  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 544 aa  1051    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 		 534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6678  major facilitator superfamily MFS_1  43.96 
 
 		 523 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1007  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 536 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1024  major facilitator superfamily transporter  38.58 
 
 		 536 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1034  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 536 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 607 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 		 507 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 		 534 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4140  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.57 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5055  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 524 aa  241  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 533 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.04 
 
 		 525 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.34 
 
 		 519 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.1 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.22 
 
 		 503 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0890  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 		 565 aa  226  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 520 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.76 
 
 		 532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 519 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5160  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.89 
 
 		 509 aa  220  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.19 
 
 		 531 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.44 
 
 		 522 aa  219  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 		 538 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  37.14 
 
 		 457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.23 
 
 		 626 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.79 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.8 
 
 		 478 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.53 
 
 		 540 aa  206  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.39 
 
 		 488 aa  205  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.32 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.32 
 
 		 478 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 		 519 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 511 aa  203  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 500 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 		 502 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 486 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 486 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 486 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 490 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.28 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 		 504 aa  200  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 478 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 509 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 500 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.62 
 
 		 484 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 		 502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  34.28 
 
 		 492 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.89 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 555 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.71 
 
 		 510 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 503 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.59 
 
 		 539 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.18 
 
 		 505 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 533 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 		 493 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.53 
 
 		 487 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 495 aa  194  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.35 
 
 		 488 aa  193  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.38 
 
 		 492 aa  193  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 465 aa  193  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.6 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.98 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 		 509 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 501 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 584 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 524 aa  190  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.54 
 
 		 486 aa  190  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 		 509 aa  190  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7124  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 517 aa  190  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.62 
 
 		 788 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 487 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 521 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  33.56 
 
 		 535 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.61 
 
 		 467 aa  188  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 526 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.44 
 
 		 646 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 508 aa  188  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  35.92 
 
 		 502 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 532 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.49 
 
 		 500 aa  187  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 		 512 aa  187  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 646 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 646 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  35.16 
 
 		 517 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 		 525 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>