11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7956 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7956  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  713    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0599296  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0514  hypothetical protein  37.5 
 
 
454 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591074  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5725  hypothetical protein  34.38 
 
 
509 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0492  hypothetical protein  34.73 
 
 
403 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00346684  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2652  hypothetical protein  35.6 
 
 
226 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.909396  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2651  hypothetical protein  31.89 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468315  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  35.29 
 
 
633 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6381  hypothetical protein  31.58 
 
 
414 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1512  hypothetical protein  32.04 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  29.61 
 
 
544 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3112  hypothetical protein  37.74 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>