104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7365 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7365  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
97 aa  190  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  63.74 
 
 
179 aa  120  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  48.28 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  55.36 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  41.77 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  44.87 
 
 
208 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  39.19 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  36.9 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 
129 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  44.58 
 
 
228 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  33.33 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  42.86 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  31.4 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  42.35 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  43.64 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 
124 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  37.5 
 
 
122 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.65 
 
 
193 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  37.36 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  30.21 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  50.98 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  31.76 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  34.07 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
173 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  37.35 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  37.97 
 
 
126 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  38.46 
 
 
146 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.65 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  42.03 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  33.33 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4411  camphor resistance protein CrcB  49.02 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  37.35 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  35.63 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  37.35 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
126 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  39.44 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  36.05 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  37.8 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  32.94 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  35.63 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  24.73 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  41.67 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  31.76 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  38.89 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5115  Camphor resistance CrcB protein  36 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  35.29 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  34.72 
 
 
130 aa  43.5  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  39.39 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  35.63 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  36.14 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  30.59 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  30.53 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  31.87 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  35.29 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5764  Camphor resistance CrcB protein  57.14 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  36.76 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1284  integral membrane protein for chromosome condensation  31.82 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000191693  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  41.82 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  36.76 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  36.76 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1306  CrcB protein  33.8 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  30.95 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  34.94 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1468  CrcB protein  33.8 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  37.66 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  40.62 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  38.24 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  32.56 
 
 
128 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  30.23 
 
 
99 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  36.84 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01601  hypothetical protein  35.23 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  32.43 
 
 
135 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0015  camphor resistance CrcB protein  35.38 
 
 
126 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  31.76 
 
 
118 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  36.47 
 
 
124 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  43.42 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  31.03 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.54 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  40.43 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  39.06 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  34.25 
 
 
156 aa  40.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  30.12 
 
 
129 aa  40.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  31.94 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.53 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  33.75 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>