14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4974 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4974  HTTM domain protein  100 
 
 		 362 aa  729    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106846  normal  0.33114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1483  HTTM domain protein  46.49 
 
 		 468 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0552  hypothetical protein  24.1 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0564  HTTM domain-containing protein  24.1 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0542  HTTM domain-containing protein  24.1 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1644  HTTM  20.08 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3598  HTTM domain protein  26.58 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31770  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3264  HTTM domain protein  27.07 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4244  HTTM domain protein  25.56 
 
 		 370 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.232195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0899  HTTM domain protein  26.64 
 
 		 521 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0340  hypothetical protein  25.1 
 
 		 636 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0068  HTTM domain protein  26.96 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2781  hypothetical protein  27.43 
 
 		 276 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372297  normal  0.263636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>