11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4968 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4968  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
312 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293312  normal  0.100747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2658  UbiA prenyltransferase  35.34 
 
 
302 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3174  UbiA prenyltransferase  29.93 
 
 
309 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.694919  normal  0.880565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  31.33 
 
 
283 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  27.78 
 
 
343 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  26.57 
 
 
277 aa  46.2  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.79 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  28.86 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  29.38 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.93 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.67 
 
 
333 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>