29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4588 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4588  Protein of unknown function DUF1963  100 
 
 
295 aa  594  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554117  normal  0.0118045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1714  hypothetical protein  32.41 
 
 
261 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835066  normal  0.178901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6141  Protein of unknown function DUF1963  30.42 
 
 
257 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3402  Protein of unknown function DUF1963  29.81 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2027  hypothetical protein  28.11 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2634600000000004e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1822  hypothetical protein  26.91 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1851  hypothetical protein  26.91 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000701527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1994  hypothetical protein  26.91 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2091  hypothetical protein  26.91 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1806  hypothetical protein  27.71 
 
 
250 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000261243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1857  hypothetical protein  26.8 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2072  hypothetical protein  25.7 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000993237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1996  hypothetical protein  26.1 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3333  hypothetical protein  24.9 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000356004  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2451  hypothetical protein  25 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.612339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2757  hypothetical protein  23.37 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00142476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2434  hypothetical protein  24.52 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0218077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2468  hypothetical protein  24.52 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2692  hypothetical protein  24.14 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2507  hypothetical protein  24.14 
 
 
271 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000307283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4160  hypothetical protein  28.27 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2707  hypothetical protein  24.03 
 
 
271 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000135449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37290  protein of unknown function (DUF1963)  24.57 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.132854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2711  hypothetical protein  24.22 
 
 
271 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0556  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  43.75 
 
 
280 aa  45.8  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.565002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2598  hypothetical protein  22.43 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1909  hypothetical protein  21.92 
 
 
394 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.0057636  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1963  Protein of unknown function DUF1963  23.02 
 
 
276 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1886  hypothetical protein  26.57 
 
 
838 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292841  normal  0.495378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>