15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4316 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4316  putative lipoprotein  100 
 
 
485 aa  967    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280453  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  41.61 
 
 
642 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27850  hypothetical protein  31.38 
 
 
547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1351  hypothetical protein  30.77 
 
 
474 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.625365  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1579  putative lipoprotein  30.77 
 
 
474 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1742  hypothetical protein  35.54 
 
 
670 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0523  putative lipoprotein  30.54 
 
 
474 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0632  putative lipoprotein  30.54 
 
 
474 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1554  putative lipoprotein  30.54 
 
 
489 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01110  expressed protein  25.83 
 
 
665 aa  68.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06480  hypothetical protein  25.5 
 
 
511 aa  67  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1639  hypothetical protein  23.91 
 
 
488 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  25.27 
 
 
719 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10868  conserved hypothetical protein  25.7 
 
 
502 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01540  expressed protein  24.38 
 
 
534 aa  47.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>