72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4304 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4304  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 342 aa  692    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0262518  hitchhiker  0.00234368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  60.78 
 
 		 339 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.886239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1690  twin-arginine translocation pathway signal  55.33 
 
 		 363 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.525847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8277  ABC transport system substrate-binding protein  53.39 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0627957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3033  hypothetical protein  54.61 
 
 		 343 aa  350  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233167  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4935  NMT1/THI5 like domain protein  55.1 
 
 		 377 aa  349  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1367  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic solute-binding protein  47.29 
 
 		 368 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520696 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4215  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.5 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6388  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  33.65 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.249456 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5127  Fis family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4540  NMT1/THI5 like domain protein  32.09 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184718 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  32.61 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  30.69 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44550  ABC transporter periplasmic component  30.1 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  27.34 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2013  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.74 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5003  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.86 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00833657  normal  0.452376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  28.39 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.27 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1386  NMT1/THI5 like domain protein  26.05 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0708461  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4149  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.54 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0138672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40070  periplasmic sulfonate-binding protein of ABC transporter  25.08 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2438  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.82 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.07 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  26.79 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  24.38 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1779  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.62 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0714  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  29.41 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.924005  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4089  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.91 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.83 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.23 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  23.83 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4201  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.91 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7647  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1682  hypothetical protein  22.56 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2848  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.65 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1563  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein SsuA  24.35 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000779716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19540  hypothetical protein  22.56 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  24.92 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.85 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4975  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.84 
 
 		 321 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000230006  hitchhiker  0.00807974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  28.79 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7013  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.62 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377045  hitchhiker  0.00497877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0237  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.09 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0767  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.92 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.250566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0261  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.84 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766816  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  23.83 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  27.03 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1211  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.37 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0252  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.09 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0269114  normal  0.27021 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.53 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4301  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  30.6 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389589  hitchhiker  0.0000586034 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1186  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  26.15 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.217841  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1089  taurine ABC transporter, taurine-binding protein  26.15 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5002  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.85 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016963  normal  0.417754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.44 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  26.52 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  26.52 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1455  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  25 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0687578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  26.52 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.5 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3031  ABC aliphatic sulfonates transporter, periplasmic ligand binding protein  23.22 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  23.44 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5414  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.72 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.445951  hitchhiker  0.00207004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  23.44 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  29.2 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3067  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  27.81 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  25.17 
 
 		 345 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  27.69 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  27.27 
 
 		 342 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3871  putative sulfonate binding protein precursor  24.65 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.080113  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 340 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>