15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3874 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3874    100 
 
 
1013 bp  2008    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00914635  normal  0.0352194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  82.52 
 
 
1068 bp  61.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  85.92 
 
 
1074 bp  61.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  89.36 
 
 
486 bp  54  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  89.36 
 
 
1002 bp  54  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  90.48 
 
 
393 bp  52  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6346    81.91 
 
 
523 bp  52  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  96.55 
 
 
1107 bp  50.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  96.55 
 
 
1071 bp  50.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  96.55 
 
 
1113 bp  50.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6424    85.96 
 
 
660 bp  50.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442391  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  93.75 
 
 
1107 bp  48.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  93.75 
 
 
1107 bp  48.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  85 
 
 
1068 bp  48.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  93.75 
 
 
645 bp  48.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>