14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3070 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3070  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  317  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.28497  normal  0.0809391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2306  hypothetical protein  35.26 
 
 
166 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121889  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2353  hypothetical protein  35.26 
 
 
166 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2345  hypothetical protein  35.26 
 
 
166 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0639664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2614  hypothetical protein  33.55 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12594  hypothetical protein  35.2 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.597644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3786  hypothetical protein  32.26 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.877035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2251  hypothetical protein  32.54 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1620  hypothetical protein  28.37 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0448  hypothetical protein  30.23 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5132  hypothetical protein  40.32 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5221  hypothetical protein  40.32 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.830501 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5513  hypothetical protein  40.32 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  30 
 
 
184 aa  40.8  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>