21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2210 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2210  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.84 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.95 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  35.71 
 
 		 800 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  33.09 
 
 		 282 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.73 
 
 		 688 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.52 
 
 		 616 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  38.4 
 
 		 393 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.61 
 
 		 251 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  35.9 
 
 		 855 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  35.54 
 
 		 713 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 325 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  33.9 
 
 		 591 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0337  histidine kinase  31.85 
 
 		 408 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  45.31 
 
 		 393 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.73 
 
 		 750 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  34.15 
 
 		 437 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 169 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 657 aa  40.8  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>