More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2044 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2044  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
223 aa  440  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.133815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 
207 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 
205 aa  62  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 
255 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  36.13 
 
 
198 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  38.81 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  32.08 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  32.42 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.09 
 
 
251 aa  52.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1746  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1793  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  38.54 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1727  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 
199 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
332 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
126 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  40.54 
 
 
201 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
228 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 
192 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
214 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 
186 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
224 aa  52  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 
196 aa  51.6  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  43.66 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
277 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 
185 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  32.14 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  34.52 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 
214 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
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NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.766944 
 
 
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NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
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