82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1969 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1969  putative integral membrane protein  100 
 
 
228 aa  454  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2834  Nicotinamide mononucleotide transporter-like protein  43.2 
 
 
220 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1079  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  43.07 
 
 
220 aa  152  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1373  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  42.44 
 
 
217 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.341199  normal  0.244006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  40.62 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1330  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  39.41 
 
 
232 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1668  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.83 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000502354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10840  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.15 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00558834  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16090  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36.14 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0225  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.61 
 
 
232 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01590  nicotinamide mononucleotide transporter  31.08 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.702697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1876  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.81 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1869  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.91 
 
 
235 aa  89  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.75 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.27 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.85 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.31 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.9 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4490  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.23 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0408441  normal  0.0360062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.65 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.35 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.59 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.88 
 
 
210 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  25.95 
 
 
187 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.24 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.323942  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.99 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.11 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.11 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.11 
 
 
244 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.78 
 
 
189 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.62 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  23.12 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  22.64 
 
 
244 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.32 
 
 
241 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  22.32 
 
 
241 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.32 
 
 
241 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.37 
 
 
197 aa  55.1  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  26.53 
 
 
189 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  27.14 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.14 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.14 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2066  nicotinamide mononucleotide transporter  20.88 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  24.87 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.82 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  24 
 
 
191 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06139  hypothetical protein  21.7 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000335  ribosyl nicotinamide transporter PnuC-like protein  22.27 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.258606  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.18 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  22.22 
 
 
205 aa  48.9  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  22.22 
 
 
205 aa  48.9  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.18 
 
 
203 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.5 
 
 
220 aa  48.5  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  25.38 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3081  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.01 
 
 
241 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.368722  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2891  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.88 
 
 
239 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135178  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1255  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.35 
 
 
241 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00693  hypothetical protein  21.88 
 
 
239 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0805  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.88 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000506847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00704  predicted nicotinamide mononucleotide transporter  21.88 
 
 
239 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00368961  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0779  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.88 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.67 
 
 
203 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0775  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.88 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000228392  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2911  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.88 
 
 
239 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  0.283606 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4123  intergral membrane NMN transport protein PnuC  23.79 
 
 
243 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.53 
 
 
188 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0673  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.8 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000252701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0854  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  21.88 
 
 
239 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.2 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2849  putative transporter  25.49 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.705156  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  21.28 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4138  intergral membrane NMN transport protein PnuC  23.35 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2750  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.88 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01545  putative membrane transporter involved in nicotinamidemononucleotide transport  21.13 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1242  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  20.98 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00177208  normal  0.230051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.93 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1442  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.4 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1162  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.68 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0852  NMN family, nucleoside/purine/pyrimidine transporter  20.98 
 
 
239 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00354956  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  26.06 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2897  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.97 
 
 
241 aa  42  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000827134  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  22.46 
 
 
188 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.58 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>