47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1864 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1864  integration host factor  100 
 
 		 104 aa  197  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3448  hypothetical protein  56.73 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0809  hypothetical protein  55.88 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0768002  normal  0.858288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1860  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.39326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1853  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1661  hypothetical protein  51 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371749  hitchhiker  0.0000841753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33240  hypothetical protein  62.75 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07810  hypothetical protein  52 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.175394  normal  0.797766 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1319  hypothetical protein  47 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129436  normal  0.2348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11900  hypothetical protein  52 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000932793  normal  0.0171922 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1696  hypothetical protein  49 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.877224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2812  hypothetical protein  48.48 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1712  integration host factor-like protein  49 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4411  hypothetical protein  46.75 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0253049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3098  hypothetical protein  43.43 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3156  hypothetical protein  51.49 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  hitchhiker  0.0000150374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5239  hypothetical protein  54.46 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1061  hypothetical protein  49.49 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3196  putative integration host factor MihF  47 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.242589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2579  putative integration host factor  53 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130539  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1359  hypothetical protein  48 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19805  normal  0.0604733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2344  hypothetical protein  54 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2435  hypothetical protein  41.41 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2410  MihF  54 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2666  MihF  54 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2416  MihF  54 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.623884  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2369  MIHF  54 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0348363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4163  hypothetical protein  54 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1563  normal  0.37873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15610  hypothetical protein  53.47 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.167288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3741  MihF  54 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1849  hypothetical protein  47 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.317329  normal  0.137078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5346  hypothetical protein  48.42 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2041  hypothetical protein  49 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  hitchhiker  0.00591086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11417  integration host factor mihF  52 
 
 		 190 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282847  normal  0.291955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3008  hypothetical protein  46.46 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000974881  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14790  hypothetical protein  47.62 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3207  hypothetical protein  35.87 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426307  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3128  hypothetical protein  46.46 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0876  hypothetical protein  42.71 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12710  hypothetical protein  42.11 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0463914  normal  0.0241518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18020  hypothetical protein  43 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00327498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1294  putative integration host factor MihF  45.54 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203046  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2993  hypothetical protein  44 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.65036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1714  hypothetical protein  39.47 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0927785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2260  putative integration host factor IHF  39 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.46856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1474  hypothetical protein  32.99 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0390254  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1997  putative integration host factor IHF  43.48 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000128008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>