11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1785 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1785  low-co2 inducible protein lcib  100 
 
 		 255 aa  510  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0330  LCIC; low-CO2 inducible protein  35.12 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2477  hypothetical protein  35.83 
 
 		 266 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000753465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0323  low-co2 inducible protein lcib  34.8 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33242  Conserved hypothetical protein  31.28 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.50965  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32401  predicted protein  29.13 
 
 		 545 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.114627  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43232  predicted protein  28.76 
 
 		 568 aa  70.1  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43234  predicted protein  28.09 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43233  predicted protein  30.94 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.479677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4605  hypothetical protein  30.28 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4839  hypothetical protein  27.74 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>