11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1618 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1618  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  100 
 
 		 1047 aa  2013    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288761  normal  0.0212894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 		 703 aa  116  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0196  hypothetical protein  34.71 
 
 		 323 aa  95.9  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1643  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 534 aa  54.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0994433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  30 
 
 		 377 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 461 aa  49.3  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  23.99 
 
 		 446 aa  48.5  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 554 aa  48.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2889  Serine/threonine protein kinase-like protein  23.74 
 
 		 668 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888363  normal  0.315784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1423  serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 		 776 aa  46.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 		 855 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>