20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1483 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1483  HTTM domain protein  100 
 
 		 468 aa  951    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4974  HTTM domain protein  42.39 
 
 		 362 aa  283  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106846  normal  0.33114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3598  HTTM domain protein  21.12 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0552  hypothetical protein  22.47 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0564  HTTM domain-containing protein  22.47 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0542  HTTM domain-containing protein  22.47 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2175  HTTM domain protein  19.85 
 
 		 605 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2237  HTTM domain protein  19.85 
 
 		 605 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1644  HTTM  17.89 
 
 		 602 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1276  HTTM domain protein  22.32 
 
 		 517 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0899  HTTM domain protein  22.92 
 
 		 521 aa  54.7  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0621  HTTM domain protein  22.91 
 
 		 538 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0068  HTTM domain protein  29.31 
 
 		 319 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4244  HTTM domain protein  24.08 
 
 		 370 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.232195  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0076  HTTM domain protein  19.15 
 
 		 613 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.373411  normal  0.667135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0078  HTTM domain protein  19.15 
 
 		 613 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3264  HTTM domain protein  27.53 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2331  HTTM domain protein  20.46 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.524598 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1602  HTTM domain protein  21.54 
 
 		 505 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2239  hypothetical protein  21.85 
 
 		 529 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>