17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1282 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1282  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1416  hypothetical protein  34.89 
 
 
275 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265711  normal  0.0385868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2018  hypothetical protein  31.29 
 
 
274 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1683  hypothetical protein  31.29 
 
 
274 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187781  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0296  protein of unknown function DUF74  33.21 
 
 
290 aa  122  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.157183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1283  protein of unknown function DUF74  30.79 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11788  hypothetical protein  36.93 
 
 
262 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9814e-41  hitchhiker  0.00000283904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2019  hypothetical protein  28.65 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00266391  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1684  hypothetical protein  28.65 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275984  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  38.57 
 
 
158 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  38.57 
 
 
158 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  43.28 
 
 
144 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  32 
 
 
108 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  34 
 
 
106 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  34 
 
 
106 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02090  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0876  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>