12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0492 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0492  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  830    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00346684  hitchhiker  0.00191314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5725  hypothetical protein  29.6 
 
 
509 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0514  hypothetical protein  26.54 
 
 
454 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591074  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7956  hypothetical protein  34.73 
 
 
358 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0599296  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6381  hypothetical protein  32.41 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2651  hypothetical protein  28.33 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468315  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2652  hypothetical protein  29.34 
 
 
226 aa  60.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.909396  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  27.91 
 
 
633 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1510  hypothetical protein  25.38 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1512  hypothetical protein  25.79 
 
 
283 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4259  hypothetical protein  26.88 
 
 
847 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178114  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0190  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  30.77 
 
 
731 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>