16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0300 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0300  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2750  hypothetical protein  34.71 
 
 
347 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3347  hypothetical protein  37.17 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.444208  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8996  hypothetical protein  36.04 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0295  hypothetical protein  35.63 
 
 
337 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0160  hypothetical protein  35.46 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261624  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4390  hypothetical protein  36.04 
 
 
291 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0169  hypothetical protein  35.58 
 
 
279 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7206  hypothetical protein  34.35 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0098  hypothetical protein  35.5 
 
 
276 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5980  hypothetical protein  31.87 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0418  hypothetical protein  25.96 
 
 
317 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0628  hypothetical protein  27.59 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6841  hypothetical protein  28.3 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37780  hypothetical protein  29.86 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.245305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01940  hypothetical protein  28.39 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>