More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0299 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0299  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  100 
 
 
362 aa  733    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0168  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  71.97 
 
 
360 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.854835  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5981  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization region  71.39 
 
 
360 aa  508  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0296  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization region  72.05 
 
 
362 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3346  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization domain-containing protein  71.3 
 
 
371 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.846718  normal  0.704979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0159  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  69.08 
 
 
360 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346246  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28230  valine dehydrogenase (NAD)  70.4 
 
 
355 aa  484  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8995  leucine dehydrogenase  69.16 
 
 
367 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4313  valine dehydrogenase (NAD)  66.3 
 
 
363 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4753  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization region  63.92 
 
 
356 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0097  valine dehydrogenase (NAD)  62.92 
 
 
356 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7207  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  61.8 
 
 
366 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169486  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2308  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.13 
 
 
367 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0262  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.55 
 
 
367 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3917  leucine dehydrogenase  47.69 
 
 
366 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.258537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2859  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.69 
 
 
366 aa  342  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4237  leucine dehydrogenase  47.69 
 
 
366 aa  342  7e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4070  leucine dehydrogenase  47.69 
 
 
366 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.103154  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3908  leucine dehydrogenase  47.69 
 
 
366 aa  342  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4387  leucine dehydrogenase  47.69 
 
 
366 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4185  leucine dehydrogenase  47.69 
 
 
366 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000087801 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4295  leucine dehydrogenase  47.69 
 
 
366 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4006  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.69 
 
 
366 aa  342  9e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0959  leucine dehydrogenase  47.69 
 
 
366 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0298672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4275  leucine dehydrogenase  47.69 
 
 
366 aa  341  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06750  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.14 
 
 
353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1681  leucine dehydrogenase  47.56 
 
 
354 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000840551  normal  0.0280258 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12928  leucine dehydrogenase  47.32 
 
 
367 aa  330  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.818858  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0423  hypothetical protein  47.86 
 
 
368 aa  330  2e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0938  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.7 
 
 
355 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1459  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  47.69 
 
 
364 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00450437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2701  leucine dehydrogenase  46.82 
 
 
362 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2201  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  48.21 
 
 
393 aa  322  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2349  leucine dehydrogenase  45.22 
 
 
358 aa  322  9.000000000000001e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.752275  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2953  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  48.39 
 
 
365 aa  320  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102694  normal  0.0444662 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06730  Leucine dehydrogenase  45.17 
 
 
354 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4303  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization region  50.59 
 
 
350 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2467  leucine dehydrogenase  46.29 
 
 
369 aa  316  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.463847  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1673  leucine dehydrogenase  46.29 
 
 
344 aa  309  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0226874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1598  leucine dehydrogenase  45.99 
 
 
344 aa  309  5e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1742  leucine dehydrogenase  45.99 
 
 
344 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2857  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization region  47.09 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2067  leucine dehydrogenase  45.66 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.866372  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2476  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  45.56 
 
 
344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.65947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1868  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  45.56 
 
 
351 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00511879  hitchhiker  0.00000368215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2483  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  45.56 
 
 
351 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2638  leucine dehydrogenase  45.99 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2596  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  45.27 
 
 
344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2238  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  44.97 
 
 
344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1823  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  44.38 
 
 
348 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.653099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01746  leucine dehydrogenase  46.33 
 
 
366 aa  300  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2265  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  45.86 
 
 
343 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1400  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  43.53 
 
 
362 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1877  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  44.71 
 
 
344 aa  292  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000134447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1555  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  44.11 
 
 
343 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.331273  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2278  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  43.88 
 
 
349 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.238812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2710  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  44.11 
 
 
343 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2543  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  43.81 
 
 
343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2904  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  43.02 
 
 
345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.411111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2878  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  44.84 
 
 
365 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00467332  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2995  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  42.52 
 
 
371 aa  279  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0400404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1037  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  48.54 
 
 
349 aa  278  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2875  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  47.52 
 
 
352 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.734525 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02824  leucine dehydrogenase  43.85 
 
 
352 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0223445  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4625  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  45.01 
 
 
355 aa  272  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.466466  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2779  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  43.66 
 
 
356 aa  271  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.60322  normal  0.877021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1708  leucine dehydrogenase  45.92 
 
 
341 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19870  leucine dehydrogenase  46.22 
 
 
341 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020664  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2994  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization region  44.01 
 
 
352 aa  259  6e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0963  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  42.18 
 
 
357 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.922055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3241  leucine dehydrogenase  43.32 
 
 
370 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.710635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3248  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  44.44 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5816  leucine dehydrogenase  43.64 
 
 
365 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.523942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2247  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization region  42.24 
 
 
359 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1040  leucine dehydrogenase  46.45 
 
 
366 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.336829  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1973  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  45.95 
 
 
350 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278913  normal  0.5183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10760  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  43.58 
 
 
339 aa  242  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0915  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerization region  42.15 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810154  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4601  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  41.1 
 
 
339 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4617  leucine dehydrogenase  40.8 
 
 
339 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3986  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  44.15 
 
 
349 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3328  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  46.08 
 
 
353 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369761  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4477  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  40.8 
 
 
339 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1436  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  42.9 
 
 
375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0652  leucine dehydrogenase  38.84 
 
 
382 aa  232  6e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.941841  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0755  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  38.84 
 
 
364 aa  233  6e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6219  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal:Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerization region  41.76 
 
 
359 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277223  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0154  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase family protein  38.99 
 
 
346 aa  228  1e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2202  hypothetical protein  39.51 
 
 
357 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5610  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization region  42.35 
 
 
363 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0831921  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2230  hypothetical protein  39.82 
 
 
357 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3953  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  40.52 
 
 
356 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.731419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4113  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization region  38.07 
 
 
351 aa  215  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0821  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  40.8 
 
 
339 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1521  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  41.12 
 
 
349 aa  209  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448998  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4404  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization region  41.36 
 
 
357 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4087  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  40.86 
 
 
360 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.733748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1545  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerization region  39.24 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.503343  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0203  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  35.51 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4348  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase dimerisation region  38.3 
 
 
351 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.452573  normal  0.778555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>