39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0078 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0078  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 366 aa  735    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2860  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2663  aminoglycoside phosphotransferase  38.21 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000329487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3396  homoserine kinase  27.24 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4197  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0021  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00225074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0019  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000857443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4240  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00616333  normal  0.232925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0470  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4105  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  26.16 
 
 		 322 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0479  serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.242389  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  25.83 
 
 		 322 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4127  aminoglycoside phosphotransferase  30.7 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03694  hypothetical protein  30.7 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.617644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5299  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 328 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.281627  normal  0.624144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03745  predicted kinase  30.7 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.673887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4156  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0206015  hitchhiker  0.0000791829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4377  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000124881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4082  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 328 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000811117  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  26.86 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4331  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4890  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000036631  hitchhiker  0.000000828535 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002046  YihE protein required for LPS synthesis  22.48 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3969  aminoglycoside phosphotransferase  27.06 
 
 		 328 aa  46.2  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00010799  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4277  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0483  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4206  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0481233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4227  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000275192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4384  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.713425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0129  aminoglycoside phosphotransferase  20.52 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2484  serine/threonine protein kinase  24.42 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4323  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4313  homoserine kinase  24.54 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4519  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4275  serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2295  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  22.22 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0246  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000015453  hitchhiker  0.000046436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>