88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3468 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3468  putative sulfate transport protein CysZ  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2517  putative sulfate transport protein CysZ  60.83 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.160746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1686  putative sulfate transport protein CysZ  61.76 
 
 		 257 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1513  putative sulfate transport protein CysZ  56.97 
 
 		 264 aa  294  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2464  putative sulfate transport protein CysZ  59.83 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2355  putative sulfate transport protein CysZ  56.25 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1734  putative sulfate transport protein CysZ  57.31 
 
 		 257 aa  291  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  hitchhiker  0.00000000137908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1773  hypothetical protein  58.65 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1572  putative sulfate transport protein CysZ  57.43 
 
 		 259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000851255  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2899  putative sulfate transport protein CysZ  58.23 
 
 		 259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1505  putative sulfate transport protein CysZ  57.43 
 
 		 259 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  hitchhiker  0.0000000567341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1566  putative sulfate transport protein CysZ  57.03 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000261033  hitchhiker  0.0000695889 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01847  putative sulfate transport protein CysZ  52.67 
 
 		 245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2761  putative sulfate transport protein CysZ  57.43 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00115668  hitchhiker  0.0000596308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2682  putative sulfate transport protein CysZ  57.43 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000538475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1702  putative sulfate transport protein CysZ  57.43 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000296404  hitchhiker  0.000000528176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2657  putative sulfate transport protein CysZ  57.03 
 
 		 259 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2367  putative sulfate transport protein CysZ  55.42 
 
 		 259 aa  277  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1265  putative sulfate transport protein CysZ  50.61 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000198921  decreased coverage  0.0000225757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2568  putative sulfate transport protein CysZ  50.61 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000943682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2548  putative sulfate transport protein CysZ  50.61 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814239  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2767  putative sulfate transport protein CysZ  50.61 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3644  putative sulfate transport protein CysZ  50.61 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000423219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02274  hypothetical protein  50.61 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000358279  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1248  protein of unknown function DUF540  50.61 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000124469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02313  putative sulfate transport protein CysZ  50.61 
 
 		 253 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2700  putative sulfate transport protein CysZ  51.01 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399677  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2380  putative sulfate transport protein CysZ  57.56 
 
 		 257 aa  274  8e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0944134  hitchhiker  0.000158699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2941  putative sulfate transport protein CysZ  51.25 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000526268  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1014  putative sulfate transport protein CysZ  51.46 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000500888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2850  putative sulfate transport protein CysZ  56.92 
 
 		 257 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000397841 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2622  putative sulfate transport protein CysZ  50 
 
 		 287 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00041893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2794  putative sulfate transport protein CysZ  50 
 
 		 287 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0621521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2573  putative sulfate transport protein CysZ  50 
 
 		 287 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000546131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2664  putative sulfate transport protein CysZ  50 
 
 		 287 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2688  putative sulfate transport protein CysZ  50 
 
 		 287 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.211046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0777  putative sulfate transport protein CysZ  51.88 
 
 		 263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000677117  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2746  putative sulfate transport protein CysZ  53.14 
 
 		 244 aa  267  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000416155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1430  putative sulfate transport protein CysZ  53.14 
 
 		 244 aa  267  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000173702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1319  putative sulfate transport protein CysZ  53.14 
 
 		 244 aa  267  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.35913e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3267  protein of unknown function DUF540  50.42 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3189  protein of unknown function DUF540  47.08 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000074726  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01310  putative sulfate transport protein CysZ  50.42 
 
 		 249 aa  248  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3446  putative sulfate transport protein CysZ  50.61 
 
 		 253 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00219453  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0490  putative sulfate transport protein CysZ  51.87 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000555073  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004155  sulfate transporter CysZ-type  53.6 
 
 		 228 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000767256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2339  hypothetical protein  48.95 
 
 		 263 aa  235  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.747358  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0370  putative sulfate transport protein CysZ  48.5 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1015  putative sulfate transport protein CysZ  45.96 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3616  hypothetical protein  48.12 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1177  cysZ protein  45.96 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0886  putative sulfate transport protein CysZ  44.26 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53330  putative sulfate transport protein CysZ  43.1 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.442824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4674  putative sulfate transport protein CysZ  42.44 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.581083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0819  putative sulfate transport protein CysZ  44.26 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0976  putative sulfate transport protein CysZ  41.28 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.828685  normal  0.13166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0808  putative sulfate transport protein CysZ  43.4 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00684995  normal  0.0715554 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2227  protein of unknown function DUF540  39.06 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0785  putative sulfate transport protein CysZ  42.98 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0197776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4409  putative sulfate transport protein CysZ  42.98 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.285932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1834  putative sulfate transport protein CysZ  39.67 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.724541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3262  hypothetical protein  34.91 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0899601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4403  hypothetical protein  36.03 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2030  protein of unknown function DUF540  37.13 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3197  putative sulfate uptake protein  35.07 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.155979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2474  hypothetical protein  29.44 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030274  normal  0.489953 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1699  hypothetical protein  37.29 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.195825  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10220  putative sulfate transport protein CysZ  40.64 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1712  putative sulfate transport protein CysZ  31.98 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1024  CysZ protein  27.53 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000955852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1581  protein of unknown function DUF540  29.13 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.768375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0890  hypothetical protein  24.9 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4416  hypothetical protein  22.63 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.921944  normal  0.0304901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1157  protein of unknown function DUF540  22.82 
 
 		 272 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.377801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1193  protein of unknown function DUF540  24.89 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.436714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0416  protein of unknown function DUF540  23.53 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.881692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2099  protein of unknown function DUF540  23.75 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000514107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1126  protein of unknown function DUF540  21.84 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7196  putative sulfate transport protein CysZ  24.88 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5501  protein of unknown function DUF540  23.31 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000395042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3441  hypothetical protein  21.95 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0964499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21450  uncharacterized protein involved in cysteine biosynthesis  25.97 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.412828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2442  hypothetical protein  25.87 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0221132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0384  hypothetical protein  24.03 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0202  protein of unknown function DUF540  22.35 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0634  putative integral membrane protein  26.14 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.12816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5770  hypothetical protein  23.9 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03620  hypothetical protein  25.48 
 
 		 217 aa  42.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>