31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3046 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3046  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  805    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2937  hypothetical protein  61.29 
 
 
399 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.336844  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1982  hypothetical protein  37.06 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000915947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1045  hypothetical protein  38.57 
 
 
416 aa  209  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1367  hypothetical protein  32.69 
 
 
536 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2725  hypothetical protein  30.71 
 
 
414 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2873  hypothetical protein  31.57 
 
 
399 aa  149  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0689  hypothetical protein  27.86 
 
 
459 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0866657  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2512  hypothetical protein  29.7 
 
 
413 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231134  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2244  hypothetical protein  27.7 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.0297405 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2343  hypothetical protein  30.82 
 
 
513 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.902991 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2453  hypothetical protein  27.34 
 
 
401 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1395  hypothetical protein  24.36 
 
 
422 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0118  hypothetical protein  30.07 
 
 
496 aa  106  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.157698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3256  hypothetical protein  30 
 
 
495 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2424  hypothetical protein  24.65 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3575  hypothetical protein  24.81 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1868  hypothetical protein  25.53 
 
 
385 aa  96.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3009  hypothetical protein  27.73 
 
 
418 aa  96.3  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0425000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1652  hypothetical protein  33.11 
 
 
505 aa  89.7  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1931  hypothetical protein  24.46 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.930432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2170  hypothetical protein  24.33 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2662  hypothetical protein  24.33 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.723474  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3141  hypothetical protein  24.09 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2601  hypothetical protein  22.51 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000556017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1938  hypothetical protein  24.73 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.915381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3661  hypothetical protein  29.55 
 
 
503 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.159613  normal  0.176734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3321  hypothetical protein  27.25 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.242267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39000  hypothetical protein  26.74 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00275655  normal  0.388299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1287  hypothetical protein  26.6 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.46065e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0893  hypothetical protein  24.38 
 
 
442 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.218351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>