22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2783 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2783  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0641  hypothetical protein  29.84 
 
 
252 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03387  iron permease, FTR1 family protein  27.96 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3198  iron permease FTR1  22.94 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521431  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0883  FTR1 family iron permease  23.98 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0912  OFeT family iron transporter  23.98 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.29643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0510  OFeT family iron transporter  23.98 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0608  OFeT family iron transporter  23.98 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189417  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0012  OFeT family iron transporter  23.98 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1742  OFeT family iron transporter  23.98 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0322131  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2033  FTR1 family iron permease  23.98 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1923  FTR1 family iron permease  23.98 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3854  iron permease FTR1  30.77 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  26.02 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1955  iron permease FTR1  22.36 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0621861  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2875  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  26.51 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2722  FTR1 family iron permease  26.51 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1108  FTR1 family iron permease  26.51 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2124  iron permease FTR1  22.76 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640841  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5535  Iron permease FTR1  23.27 
 
 
280 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2245  iron permease FTR1  22.39 
 
 
280 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.998183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  26.6 
 
 
308 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>