19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2337 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2337  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00111384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2189  hypothetical protein  38.24 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000588591  hitchhiker  0.0000414768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1621  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000478704  decreased coverage  6.99573e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1440  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568816  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1838  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00855193  hitchhiker  0.000200494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1896  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00137818  hitchhiker  2.4531500000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1833  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00320514  unclonable  4.904429999999999e-31 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2368  protein of unknown function DUF1049  36.76 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  6.48025e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01267  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000287085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1913  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000266847  unclonable  1.58783e-24 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1507  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1850  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000437894  unclonable  2.67694e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2347  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000010556  unclonable  0.00000001629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1481  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000597694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1390  hypothetical protein  36.76 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000611477  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01256  conserved inner membrane protein  36.76 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000209793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1734  protein of unknown function DUF1049  35.59 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000818234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2642  protein of unknown function DUF1049  30.38 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000164462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2368  hypothetical protein  29.11 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00228618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>