36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1415 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1415  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.130351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2718  hypothetical protein  63.03 
 
 		 123 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  53.85 
 
 		 119 aa  140  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2676  hypothetical protein  47.86 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208691  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2142  hypothetical protein  47.01 
 
 		 123 aa  123  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1946  hypothetical protein  47.86 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000181986  normal  0.0225511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2030  hypothetical protein  45.3 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2142  hypothetical protein  45.3 
 
 		 124 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000300583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2314  hypothetical protein  47.62 
 
 		 135 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  43.59 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  43.59 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  43.59 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1903  hypothetical protein  42.74 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000176347  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1711  hypothetical protein  43.64 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02381  hypothetical protein  46.94 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003401  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000284049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0867  hypothetical protein  42.31 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  37.89 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3876  hypothetical protein  27.27 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  28.16 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  27.88 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  26.92 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  32.08 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  26.67 
 
 		 126 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  26.67 
 
 		 126 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  26.67 
 
 		 126 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  27.18 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1921  hypothetical protein  28.57 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.743807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  27.18 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  29.21 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>