More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1953 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2241  sensor histidine kinase  90.56 
 
 		 678 aa  1085    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00553102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1953  sensor histidine kinase  100 
 
 		 678 aa  1300    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3383  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 617 aa  170  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1243  sensory box histidine kinase  32.43 
 
 		 623 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1523  sensory box histidine kinase  35.53 
 
 		 787 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1316  sensory box histidine kinase  35.53 
 
 		 787 aa  167  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00351204  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1055  sensory box histidine kinase/response regulator  43.75 
 
 		 558 aa  163  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.952288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2076  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52949  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0195  sensory box histidine kinase  33.65 
 
 		 791 aa  160  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00184929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 424 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0198  sensory box histidine kinase  33.17 
 
 		 791 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00155091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 652 aa  152  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1954  sensor histidine kinase  33.69 
 
 		 624 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2242  sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 620 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000101794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0511  histidine kinase  31.56 
 
 		 440 aa  128  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000775208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 885 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 1162 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  32.16 
 
 		 1086 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1255 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 		 944 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 1349 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  31.44 
 
 		 1093 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  30.17 
 
 		 1344 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 917 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 945 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5320  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 903 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 		 799 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 1153 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 		 1271 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  30.18 
 
 		 1156 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 		 1352 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 		 839 aa  115  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 1155 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  31.3 
 
 		 661 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  32.02 
 
 		 1137 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 1319 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  29.52 
 
 		 1306 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 		 896 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 1039 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 		 1131 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  27.31 
 
 		 1172 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 1385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 901 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 1002 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 1045 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 		 1126 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  26.83 
 
 		 876 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  24.26 
 
 		 584 aa  111  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 682 aa  111  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 965 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  31.82 
 
 		 1161 aa  111  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.01 
 
 		 1363 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 1137 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.67 
 
 		 1233 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 514 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 889 aa  110  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  24.62 
 
 		 591 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  27.13 
 
 		 725 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 638 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 1370 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 1118 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 		 1180 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  33.33 
 
 		 1344 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 		 969 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  28.93 
 
 		 982 aa  109  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  27.78 
 
 		 1152 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 		 989 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1356 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 		 569 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  29.46 
 
 		 455 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 1048 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.24 
 
 		 953 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.52 
 
 		 709 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.84 
 
 		 973 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 1159 aa  108  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1084 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 		 754 aa  108  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  29.44 
 
 		 357 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 		 1199 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 770 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 815 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 827 aa  107  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  32.57 
 
 		 561 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 903 aa  107  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 2153 aa  107  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 2161 aa  107  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 763 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  27.85 
 
 		 1202 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 763 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 		 1362 aa  107  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  28.33 
 
 		 925 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 556 aa  107  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  25.23 
 
 		 741 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 763 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 		 1374 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 		 773 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 919 aa  107  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  27.66 
 
 		 1361 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>