61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1877 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1877  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 218 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000367804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2166  single-stranded DNA-binding protein  99.08 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000374562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2188  single-stranded DNA-binding protein  61.5 
 
 		 215 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1522  single-stranded DNA-binding protein  57.53 
 
 		 226 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.183332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0559  single-stranded DNA-binding protein  63.9 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1460  single-stranded DNA-binding protein  57.34 
 
 		 214 aa  247  9e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3483  single-stranded DNA-binding protein  55.98 
 
 		 211 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000160494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  32.74 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  31.31 
 
 		 134 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  30.08 
 
 		 146 aa  52  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  31.52 
 
 		 150 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  35.11 
 
 		 169 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  24.03 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 166 aa  48.5  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  31.46 
 
 		 168 aa  48.1  0.00009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  29.9 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  32.32 
 
 		 142 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 140 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  23.73 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  29.07 
 
 		 161 aa  45.4  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  31.91 
 
 		 164 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  31.91 
 
 		 164 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  28.23 
 
 		 138 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  28.95 
 
 		 164 aa  45.1  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  28.95 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  28.95 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1869  single-strand binding protein  24.55 
 
 		 129 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  28.95 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  28.95 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  28.95 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  28.95 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  30.85 
 
 		 142 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  28.95 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  30.85 
 
 		 142 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  28.57 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  28.57 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  28.95 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  27.27 
 
 		 114 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  29.17 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  28.95 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  28.95 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  23.81 
 
 		 301 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  30.85 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  30.59 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  30.85 
 
 		 172 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 146 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  27.59 
 
 		 142 aa  42.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  26.8 
 
 		 139 aa  42.4  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  23.93 
 
 		 160 aa  42  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 125 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 125 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  32.53 
 
 		 156 aa  41.6  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  32.53 
 
 		 156 aa  41.6  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  32.53 
 
 		 156 aa  41.6  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  32.53 
 
 		 156 aa  41.6  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  25.62 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  28.42 
 
 		 166 aa  41.6  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>